2003年10月18日，淘宝网首次推出支付宝服务。2004年，支付宝从淘宝网分拆独立，逐渐向更多的合作方提供支付服务，发展成为中国最大的第三方支付平台。
2004年12月8日，浙江支付宝网络科技有限公司成立。
2005年2月2日，支付宝推出“全额赔付”支付。
2008年2月27日，支付宝推出手机支付业务。
2008年10月25日，支付宝公共事业缴费上线，支持水、电、煤、通讯等缴费。
2010年12月23日，支付宝与中国银行合作，推出信用卡快捷支付。
2011年5月26日，支付宝获得央行颁发的《支付业务许可证》（业内又称“支付牌照”）。
2013年6月，支付宝推出账户余额增值服务“余额宝”。